برنامه نویسی بیوانفورماتیک در R

یک package R هست که باگ داره و در لینوکس فقط کار می کنه. این پکیچ نمی تونه بفهمه که داده ها در بعضی جاها یه دفعه تغییر دارند و به عنوان شکستگی اعلام می کنه. ( شکل یک و دو در پیوست). راه حلش چند خط کد هست که اگه در یک ناحیه نسبت به اگزون های قبل و بعد به نسبتی خاص(مثلا 30 درصد بشه) دچار کاهش مقدار بشه حذفش کنه. می خواهم داده های اینجوری حذف بشه تا باگ رفع بشه پکیج رو درست کنم مقاله اش در لینک پایین هست. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5389578/ دوم اینکه همانطور که در پیوست مشاهده می کنید، خود نرم افزار نقاط حذف اگزونها رو مشخص کرده و نمودار داده. من می خواهم خودم هم بتوانم از قابلیت استفاده کنم و بهش موقعیت کروموزومی و اگزونی بدهم، و نرم افزار پلات ی بده که اگزون های مجاور رو به هم متصل کنه و بده. یعنی در پروژه دوم، کد ها رو دستکاری کرده و مستقلا یه ابزار جدید و کوچک برای مشاهده اگزون ها داشته باشیم با داده های داده شده. دقیقا مانند پلات خود نرم افزار قیمت رو خودتون بفرمایید